No sistema pelo módulo "ADM" acesse o menu superior "Atalhos" e entre na opção "Painel de Boletos".
Já no painel selecione "Carteira" (conta do banco ao qual deseja gerar os boletos bancários) e também selecione um "Período Vencimento" (que são os vencimentos dos movimentos) depois basta pesquisar.
No painel de nome "Boletos Emitidos" selecione alguma das situações possíveis (Ativo ou Moderação) pois boleto quitado não se pode cancelar e a outra situação seria dos já cancelados.
Entre no boleto desejado e nas ações clique em "Cancelar".
Observação: esse processo é o mesmo para boletos digitais como no exemplo acima (IUGU) e boletos convencionais (Arquivo Remessa e Retorno) mas atente-se que boletos convencionais o sistema irá disponibilizar na área de download do painel de boletos um arquivo de remessa do(s) boleto(s) cancelado(s) para que insira no banco para o mesmo efetuar o cancelamento por lá.